医院新医疗科研楼建成后，医院科研实验面积由原来的1500㎡大幅提升至6000㎡，占据新楼后楼的5、7、8、9、10五个层面。随着场地的扩大、人员的增加、科研需求的转变，同时配合国家儿童医学中心建设规划，以转化所为实体的专职科研条线进行了结构调整，转化所研究室由原来的6个扩展到10个，从更广角度、更深层面开展临床科研合作和促进成果转化。根据医院阶段性战略发展需要，原来主要面向专职科研团队的中心实验室、实验动物中心和生物样本库，在人、财、物的配备后功能更加完善，面向全院临床提供科研平台支持和技术服务，更好的服务临床科研，促进基础和临床合作。经过2019年度的转型升级，形成了以国家卫生健康委儿童血液肿瘤重点实验室、转化所、心研所、健康所为核心的三所一室布局，配备中心实验室、实验动物中心和生物样本库三大平台，组建儿童脑科学研究中心、小儿结构性心脏病虚拟仿真技术中心、儿童人工智能临床应用及研发中心，同时有上海儿童医学中心—波士顿儿童医院分子遗传诊断联合实验室、上海儿童医学中心—圣述德儿童研究医院儿童肿瘤联合实验室、上海儿童医学中心—生物梅里埃联合实验室三个中外联合实验室开展国际合作。目前正在以此为基础组建儿科临床研究院，承担更高层次的科研职责，为建设有中国特色的研究型儿童医院做出贡献。

　　国家卫生健康委儿童血液肿瘤重点实验室

　　卫生部儿童血液肿瘤重点实验室的依托单位上海儿童医学中心血液/肿瘤科是我国儿童血液/肿瘤领域中规模最大，临床治疗、科学研究、教育培训等体系最为完备，诊治水平最为先进的国家“211工程”、“985工程”重点建设单位和教育部、上海市重点学科单位。年专科门诊量超过6.0万余次，每年收治新发儿童白血病超过500例，儿童实体瘤超过200例，其它血液系统疾病超过1000例次，干细胞移植数量已达100例/年。在重点实验室的建设中，我们着重进行研究能力的培育和对重点问题进行深入和系统性研究，争取利用5～10年的时间，使之成为集基础研究、教育培训、临床转化和国际合作为一体的国际先进、亚洲一流儿童血液/肿瘤重点实验室，研究成果逐步向临床转化，为我国卫生行政主管部门制定全国性临床诊治路径提供参考，使得我国儿童血液/肿瘤疾病的诊治和研究水平获得质的提升。作为我国最大的儿童白血病和恶性实体瘤诊治中心，出院5000人次/年，平均住院天数为9.4天，经治患儿中85%来自上海之外的全国各地和东南亚地区，长期随访率达到90%，各项指标均位居全国所有儿童医院之首。作为我国最大的儿童血液/肿瘤专业高级进修医师培训单位，经我科培训的儿童血液/肿瘤专业医师已遍及全国30多个省市和自治区，极大的促进了兄弟单位的临床治疗水平。

　　儿科转化医学研究所

　　上海交通大学医学院附属上海儿童医学中心医学院儿科转化医学研究所成立于2009年10月，是国内首家儿科转化医学研究机构。转化所依托医院优势重点学科，整合全院科研资源，结合国内儿童疾病的特点，针对严重危害儿童身体健康和身心健康的重大疾病，如恶性肿瘤、儿童先天性遗传疾病（主要包括，先天性心脏病、先天性神经管畸形等），以及儿童心理行为问题及发育障碍等开展相关研究，将这些疾病的关键临床问题转化为生物学科学问题，以基础研究成果为基石，提出科学假设，组织多学科的合作攻关，以现代科学研究手段，找出答案；另一方面，应用最新科学技术分析系统临床样本，发现新的科学理论依据。

　　转化所下辖10个研究室：心血管病研究室主要进行人类心肌细胞分化增值潜能及分子特征研究和心脏发育生物学研究，并在先心病分子调控网络方面取得初步成果；血液肿瘤研究室开展基于FCM的白血病免疫分型方案以及MRD检测方案和基于二代测序技术的儿童白血病发病和复发机制的研究工作，建立了肿瘤耐药复发研究平台和肿瘤免疫研究平台；出生缺陷研究室建立了分子诊断实验平台进行罕见疑难病分子诊断和发病机理研究，建立并完善10余种罕见、疑难病的基因诊断方法开展相关研究并取得显著成果；儿童发育行为研究室完善了发育行为分析平台，可对动物的情绪、学习、记忆等行为表型的相关研究提供指导；感染研究室是一个集临床检测，临床研究和基础研究为一体的研究室，包括分子诊断和粪菌移植两个平台，分子诊断平台主要进行感染性疾病的分子诊断，粪菌移植平台为粪菌移植提供标准化制备的粪菌，研究方向主要包括感染性疾病诊断新技术的临床应用，感染性疾病新分子标志物的探索；临床药理研究室主要通过高效液相色谱质谱分析平台和膜片钳电生理技术平台，建立正常和异常病理状态下的药物代谢模型，同时从细胞离子通道水平上探讨药物的作用机制，为临床合理用药提供理论指导和应用依据；代谢组学研究室从事高通量代谢物检测和技术应用研发，包括靶向代谢组和全代谢组，涉及糖代谢，三羧酸循环，核苷酸，氨基酸多胺等中心代谢通路和辅因子代谢,通过高通量监测体内代谢物水平，最大程度反映生命体对外界刺激、病理生理变化、以及本身基因突变而产生的体内代谢物水平的多元动态反应，为疾病诊断、病理研究、新药开发、药物毒理学等研究提供新的探索视角；免疫研究室主要研究不同类型原发性免疫缺陷病（PIDs）的发病机制，以及由PIDs介导的反复、重症感染所导致的免疫紊乱机制，为PIDs的临床诊断和治疗提供帮助；实体肿瘤研究室主要利用转录组、蛋白组、RNA修饰组、蛋白修饰组、代谢组等多组学整合分析揭示儿童实体肿瘤的发病机制，并结合PDO和PDX模型对儿童实体肿瘤的基因诊断、伴随诊断、靶向药物筛选、免疫治疗等方面进行转化应用研究，为肿瘤的精准诊断、治疗观察、肿瘤耐药及药敏评价、复发转移监测及肿瘤精准治疗提供新的诊疗思路以及技术平台；计算生物学研究室聚焦基因组研究中计算模型和工具的开发，联合血液肿瘤科搭建了儿童血液肿瘤标准化云基因组分析平台，推动我国儿童肿瘤精准医疗。

　　儿科转化医学研究所以科研成果转化为目标，促进医院各学科科研资源和临床资源的有效整合，将各学科的科研活动尽快纳入有序化管理体系，推动医院、学科的科研工作步入良性可持续发展轨道；同时加强学科间的交叉与融合，促进院内外各学科间的强强联合，以增强学科的自身竞争力，推动医院学科建设和综合竞争力的整体高层次飞跃和发展。转化所立足儿童健康事业，研究成果不仅是对科学问题的探索，更重要的是对儿童重大疾病的认识和为研究新的诊断技术、治疗方法和药物提供关键的理论依据和技术支撑，从而有助于儿童重大疾病和重要健康问题的规范化综合防治体系的研究和建立。

　　小儿先天性心脏病研究所

　　上海市小儿先天性心脏病研究所是我国唯一的先天性心脏病基础与临床研究中心。早在上世纪七十年代初，第一任所长丁文祥教授等老一辈专家在攻克一个又一个临床关键技术的同时，开展各种临床研究工作，大胆研发基于生物医学工程的先天性心脏病（简称先心病）外科围产化设备和器材，诞生了我国第一台小儿人工心肺机及其他配套器械，不仅促进了我国小儿心血管学科的蓬勃发展，也使本学科在国内确立了开拓者和引领者的地位；研究所工作重点在应用基础研究方面，下设干细胞和再生医学研究室，组织工程和人工材料研究室，生物流体力学研究室，发育生物学研究室，重点聚焦转化研究。研究所承担了多项国家级课题的研究，如2019年国家重点基础研究计划《系统描绘hPSCs分化为心肌细胞和内皮细胞的关键调控因子》，2017年国家自然科学基金面上项目《压力负荷调控Hippo/YAP信号通路促进人类心肌细胞增殖潜能的作用及机制研究》，2017年《上海市重中之重临床医学中心-小儿心血管》等课题，促进了临床和应用基础科技成果的不断诞生，近三年来在《Circulation》，《PANS》、《Science Translational Medicine》，《Nature Communication》等国际顶尖学术期刊发表了一系列重要研究成果，获得了国家杰出青年科学基金，国家万人计划科技领军人才，上海市医学会终身成就奖，杰出贡献奖等多项奖项，为全面推动我国小儿心血管学科的发展做出了重要贡献。

　　儿童健康管理研究所

　　儿童健康管理研究所隶属于上海交通大学医学院附属上海儿童医学中心中国医院发展研究院，由上海儿童医学中心负责及建设。健康所立足于儿童的健康和发展开展研究，通过对疾病人群和健康人群的数据收集和调查分析，获得基于中国儿童人群特征的循证依据，尤其注重临床与卫生管理研究、预防医学与卫生政策研究的交叉结合，为我国宏观及微观儿童卫生政策和卫生管理工作建言献策。健康所下设四个研究室：儿童卫生政策研究室、全球儿童与青少年健康研究室、儿童健康临床标准与规范研究室、临床流行病学与生物统计研究室。目前每个研究方向均有国际/国内知名的研究带头人及相关团队。健康所研究基础深厚，研究经验丰富，曾完成2项上海市公共卫生三年行动计划（总金额约2770万元）。通过“儿童重大疾病数据合作应用中心的建立及应用”项目，协助建立的“国家卫健委全国儿童白血病诊疗管理登记系统”于2018年10月上线使用，截至2019年11月，全国593家儿童白血病定点诊疗机构中395家医疗机构上报共计34133例白血病患儿诊疗数据。通过“医体结合促进儿童青少年体质健康的策略和方法”项目，建立国内首个儿童青少年身体活动动态监测平台并发布首部《中国儿童身体活动指南》。

　　上海结构性心脏病虚拟现实工程技术研究中心

　　上海结构性心脏病虚拟现实工程技术研究中心经由上海科学技术委员会批准，自2017年以来依托上海交通大学医学院附属上海儿童医学中心开展建设。工程中心秉承“边建设、边研究、边开放”的原则，以虚拟现实技术临床应用转化为核心，实施“开放、流动、联合、竞争”的运行机制，利用现有临床资源，结合当今科技发展前沿，充分发挥“医工交叉”学科发展优势，推动儿科数字智慧化医疗临床研究与转化。现已初步建成具有独立知识产权的结构性心脏病3D数据库，具备基于计算血流动力学分析与3D打印技术，开展复杂结构性心脏病虚拟手术规划与评估的能力；通过引进虚拟现实硬件设备，利用虚拟仿真技术，开发构建结构性心脏病外科虚拟仿真手术室，开展手术仿真训练；2018年获国家教育部“首批国家虚拟仿真实验教学”项目，实现线上线下医师技能仿真培训，积极推动我国儿外科青年医师培养，提升小儿结构性心脏病个体化、精准化、智能化治疗水平。近年来工程中心先后与美国乔治亚理工、日本早稻田大学、澳大利亚麦考瑞大学，北京工业大学等科研院所，以及比利时玛瑞斯公司、法国达索公司、美国ANSYS公司等建立起良好的合作关系。通过资源共享、优势互补，工程中心将为积极推动打造我国儿科数字智慧化医疗不懈努力。

　　儿童脑科学研究中心

　　面向我国儿童健康重大需求和国际脑科学前沿，国家儿童医学中心（上海）-上海交通大学医学院附属上海儿童医学中心成立儿童脑科学研究中心。中心将整合上海交通大学医学院附属上海儿童医学中心基础脑科学、临床医学、儿科学以及工科等优势资源，建立“脑智发育”协同创新团队；加强与国际一流儿童脑科学研究机构的合作，建立国际先进的高场磁共振、近红外光谱、脑电等多模态脑功能影像设施以及儿童行为发育综合评估工具库。中心同时具备转录组学、表观遗传组学、代谢组学、神经环路解剖组学及功能组学研究的实验平台，对接中国和上海市脑科学研究计划的相关任务，重点围绕共性技术平台和资源库建设，开展：1）母婴队列和儿童青少年队列研究；2）实验室控制条件和生态情境下的儿童发育脑影像研究；3）感知觉、学习记忆、社交和共情行为等基础实验研究；4）绘制胚胎脑、早产儿脑、0-6岁发育脑及儿童发育性疾病脑图谱，揭示儿童脑发育规律；5）探索遗传变异、睡眠、营养及家庭养育环境等因素对儿童脑发育的调控作用及其机制。在此基础上，形成早期脑保护和脑促进策略，产出重大创新成果，打造国际一流的儿童脑科学研究高地，为上海建设具有全球影响力的科创中心提供重要支撑和推动力。

　　儿科人工智能临床应用及研发中心

　　作为国家儿童医学中心主体建设单位、中国妇幼保健协会妇儿健康临床标准与规范委员会主委单位以及上海市东部儿联体牵头单位，儿中心一直高度重视儿科人工智能的研发和应用。儿科人工智能临床应用及研发中心2018年成立，由院领导亲自担任中心主任，宁光院士等一大批资深教授和业内专家团队担任顾问，布局的“儿科人工智能门诊辅助”、“医护机器人智慧医疗”、“儿科人工智能全病种数据治理”等多个项目已取得初步成效并在试点单位进行推广应用。中心面向全球征集儿科人工智能应用场景，围绕目前国内儿科分级诊疗的核心需求，以“儿科常见病智能辅助诊断系统、儿科疾病智能听诊以及儿科常见病治疗方案智能优化”为主要攻关方向，预期全面建成后将实现不同医疗机构诊治儿科常见疾病同质化、提升儿科常见疾病诊疗流程的安全性和规范性、提高儿科医生在常见疾病诊治中的工作效率，进而补上基层医生儿科诊疗技术短板，吸引患儿就近就医。上海市征集第二批人工智能应用场景解决方案，在智慧医疗中首次提出“赋能基层”的概念，由我院儿科人工智能临床应用及研发中心提出的《基于人工智能的儿科分级诊疗系统应用及示范》的“AI+医疗”需求项目作为前后两批智能应用7个医疗场景中唯一的儿科项目，从数百个申请和数轮专家评审中脱颖而出，与其他交通、制造、金融、旅游、教育等27个项目一起，由上海市经信委面向全球AI企业进行发布，以加快推进人工智能新技术新产品新模式在上海率先运用，打造人工智能创新应用标杆，显著提升智慧城市智敏化水平和市民感知度。中心将对标国际最高标准和最好水平，真正实现儿科常见疾病的“全程健康管理”，为儿童健康插上人工智能的翅膀。

　　共享平台

　　中心实验室：紧跟医学发展的步伐，上海儿童医学中心于2019年开始改组重建中心实验室，携手临床进行科研攻关，共同取得杰出成绩。中心实验室位于门诊综合楼九楼，占地面积500多平米，多套科研教育仪器设备70余套，下设多个功能性子实验室，拥有科学、高效的管理团队，承担各类临床科研和教学任务。中心实验室是一个开放的平台，旨在为我院医学研究提供服务。主要仪器有共聚焦显微镜，流式细胞分选仪、流式细胞分析仪，实时荧光PCR仪 、HPLC、FPLC、二代测序仪、凝胶成像仪、小动物活体成像仪、立体荧光显微镜等，形成贵重仪器的共享平台。目前，实验室团队成员全部为业务熟练或学历较高的医学科研/检验人员。现拥有技术员工(含兼职)13人，其中博导1名，博士6名，硕士及以上学历占总人员85%以上，多人曾获得国家级自然科学基金项目，逐渐形成了以高层次科研技术人才为核心，博士和硕士研究生为骨干，多学科专家指导下的综合性多层次科研团队。中心实验室根据技术发展和临床科研需要设立了细胞生物学、分子遗传学、临床免疫学等亚专业，可建立由临床科室提供科研课题，实验室进行合力攻关的模式；并搭建了人诱导性多潜能干细胞（induced pluropotent stem cells）技术平台，可诱导形成大量来源患者的干细胞，提供研究患者个性化致病机制的工具细胞。

　　生物样本库：上海儿童医学中心生物样本库成立于2009年10月，标准化收集、存储全院人体生物样本以及与其相关临床数据。现位于血液肿瘤大楼负一层，人员组成包括主任一名，专职技术员一名。生物样本库目前拥有超低温冰箱11台，大型气相液氮罐2个，采用专业的生物样本库信息软件进行样本信息管理。自成立至今，生物样本库平台已先后与院内心胸外科、心内科、儿保科、肿瘤外科、内分泌遗传代谢科、呼吸内科、骨科、神经外科、消化内科、麻醉科等15个临床科室合作收集样本，整合院内资源，实现样本分散采集，集中标准化处理和存放，集中管理。生物样本是基础研究和临床研究的能源，我院生物样本库平台已累计收集各类样本（如全血、血清、血细胞、组织、粪便、DNA等）3万余人次，合13万多管，涉及病种十分多样，包括先天性心脏病、神经管缺陷等出生缺陷性疾病，肝母细胞瘤、肾母细胞瘤等儿童实体瘤，糖尿病、肥胖等儿童代谢性疾病，矮小、性早熟等儿童发育性疾病，过敏性紫癜、系统性红斑狼疮等自身免疫性疾病，脓毒血症、呼吸道感染等感染性疾病等，目前累计为临床合作提供出库样本近1万人次。

　　实验动物部：儿中心实验动物部位于医院西北角，7号楼二楼，现有正式职工一名，保洁托管工人四名。实验动物部为动物生物安全一级设施，具备洁净的操作和饲养环境、完善的SOPs及相关设备：配有小鼠笼位1625笼和大鼠笼位188笼、解剖显微镜、无影灯、高压灭菌器、小动物呼吸麻醉机、超净工作台等。实验动物部SPF大、小鼠饲养区及动物实验区域全年对外开放。实验动物部于2011年取得上海市科委发放的SPF级小鼠饲养74㎡使用许可证书，开始正式投入使用；于2019年进行内部改建，2020年4月取得上海市科委发放的SPF级大、小鼠饲养408㎡的使用许可证书。作为公共平台可完成实验动物饲育、保种等基础工作，开展动物实验、模式动物等相关工作，为临床医学研究和基础医学研究提供保障，通过常见的心脑血管病、神经系统疾病、糖尿病、肥胖症、高血脂、血液病、肿瘤、行为发育、免疫疾病等重大疾病模型，为疾病机制研究、创新药物的研制、临床治疗方法的改进、诊断试剂或诊疗设备的创新做重要支撑，充分发挥着实验动物在生物医药领域的支撑作用。

　　中外联合实验室

　　上海儿童医学中心—波士顿儿童医院分子遗传诊断联合实验室：“上海儿童医学中心-波士顿儿童医院分子遗传诊断联合实验室”创立于2014年，美方主任为沈亦平教授，中方主任为王剑研究员，团队主要成员都曾经在哈佛医学院学习1~2年。实验室目前能够完成从单个碱基到整条染色体变异的所有遗传学实验，是国内最早开展遗传诊断的专业实验室之一，率先将基因芯片和高通量测序等技术应用于基因检测，能够对4000多种罕见遗传病开展基因诊断。所有实验室SOP、报告方式和伦理法规等均参照美国医学遗传学会推荐的指南，按照波士顿儿童医院的模式建立。截止2019年12月，已经诊断12000余例 遗传性疾病，包括5000多例罕见疑难病例，约400余种，其中至少50多种为国内首报。并为其中3000多个家庭提供遗传咨询，为减少误诊、优化治疗方案和预防提供帮助。定期与国外同行视频会诊，为罕见疑难病患儿做出及时、准确的诊断，得到有效的临床治疗决策。积极联络国内外同行共同分享和利用临床病例基因检测数据，初步建立了部分遗传病的中国人群基因突变共享数据库。

　　上海儿童医学中心—圣述德儿童研究医院儿童肿瘤联合实验室：作为美国国立癌症研究所唯一推荐的、全球儿童疑难杂症治疗和研究领域的一流医院，圣述德儿童研究医院拥有儿童白血病生物学和治疗学领域的全球领军团队，在儿童ALL临床诊治与转化研究领域享有国际权威。上海儿童医学中心拥有亚洲最大的小儿血液/肿瘤诊治中心和优秀的临床及科研团队，早在十几年前两院的合作就已经开始。2015年双方成立上海儿童医学中心—圣述德儿童研究医院儿童肿瘤联合实验室，针对儿童白血病，从基础科学研究、临床多中心研究等方面开展合作，在疾病发病机、耐药性研究等方面取得了丰硕的研究成果：揭露了磷酸核糖焦磷酸合成酶1（PRPS1）基因突变是儿童ALL治疗出现耐药和复发的重要原因之一，为在疾病复发前进行早期预测、早期干预以及新药开发等精准医学研究奠定了重要基础；率先证实阻断ALL细胞中ATM依赖的NF-κB信号通路能够克服来自骨髓微环境对化疗后微小残留白血病细胞的保护作用，显著提高ALL的化疗效果，对临床后期开展ALL联合治疗具有重要意义；系统阐述了化疗前后ALL中肿瘤细胞群体的动态克隆演化，发现了新的化疗诱导的体细胞突变特征谱，为化疗诱导耐药突变提供了直接的证据，进一步在复发的肿瘤细胞中鉴定出了新的耐药突变，为深入理解和研究ALL耐药复发的分子机制及开发相对应的干预策略提供了基础。相关内容发表在Nature Medicine、leukemia、《Blood》等知名杂志上。

　　上海儿童医学中心—生物梅里埃联合实验室：上海儿童医学中心-生物梅里埃的初次合作始于2016年11月，经过两年多的共事，双方确立建立联合实验室，并于2019年4月签订了合作协议，全面开展合作。上海儿童医学中心-生物梅里埃联合实验室由上海儿童医学中心提供场地、人员、临床样本和医学支撑，生物梅里埃配备设备、提供技术支持和人员，致力于在感染性疾病和重症领域的新生物标志物的发现、评估和验证。联合实验室研发领域包括儿童急诊和重症监护过程中细菌与病毒感染检测的生物标记物以及免疫耐受标记物的研发。另一个重要的研究领域是儿童感染或手术后，器官衰竭早期生物标记物的开发。生物梅里埃将引入全球先进的分子和蛋白检测技术，用于新生物标记物的研发和验证。相信这些研究工作可以为儿童患者，特别是重症儿童患者提供更精准、有效的诊断方法，从而使患儿及早进行治疗，提高病患生存率。目前，双方完成或者正在开展的项目有6项，已经发表SCI论文3篇，另有2篇正在投稿。